Id Ws service Name Description Input Input name Output name

13

Integr8

getGeneId

デフォルトの GeneIdオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getGeneId

13

 

Integr8

 

getGeneId

 

デフォルトの GeneIdオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getGeneIdResponse

 

parameters

 

tns:getGeneIdResponse

 

34

 

デフォルトの GeneIdオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

9

Integr8

getOrganisms

Integr8でデータ提供しているすべての生物種を取得する。

-

-

parameters

Show
getOrganisms

9

 

Integr8

 

getOrganisms

 

Integr8でデータ提供しているすべての生物種を取得する。

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getOrganismsResponse

 

parameters

 

tns:getOrganismsResponse

 

53

 

生物種に関する情報が取得できる。

 

-

 

-

 

5

Integr8

getGeneList

デフォルトの GeneListオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getGeneList

5

 

Integr8

 

getGeneList

 

デフォルトの GeneListオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getGeneListResponse

 

parameters

 

tns:getGeneListResponse

 

44

 

デフォルトの GeneListオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

21

Integr8

getXref

デフォルトの Xrefオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getXref

21

 

Integr8

 

getXref

 

デフォルトの Xrefオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getXrefResponse

 

parameters

 

tns:getXrefResponse

 

57

 

デフォルトの Xrefオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

12

Integr8

getOrganismList

デフォルトの OrganismListオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getOrganismList

12

 

Integr8

 

getOrganismList

 

デフォルトの OrganismListオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getOrganismListResponse

 

parameters

 

tns:getOrganismListResponse

 

47

 

デフォルトの OrganismListオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

18

Integr8

getOrganism

デフォルトの Organismオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getOrganism

18

 

Integr8

 

getOrganism

 

デフォルトの Organismオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getOrganismResponse

 

parameters

 

tns:getOrganismResponse

 

49

 

デフォルトの Organismオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

17

Integr8

getGeneIdList

デフォルトの GeneIdListオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getGeneIdList

17

 

Integr8

 

getGeneIdList

 

デフォルトの GeneIdListオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getGeneIdListResponse

 

parameters

 

tns:getGeneIdListResponse

 

33

 

デフォルトの GeneIdListオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

114

WSDBFetchServerLegacy

getSupportedDBs

ウェブサービスで利用できるデータベース名のリストを取得する。

-

-

getSupportedDBsReturn

Show
getSupportedDBs

114

 

WSDBFetchServerLegacy

 

getSupportedDBs

 

ウェブサービスで利用できるデータベース名のリストを取得する。

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getSupportedDBsResponse

 

getSupportedDBsReturn

 

xsd:string[]

 

2

 

データベース名のリストがstring型の配列で取得する。

 

$result = getSupportedDBs()

 

取得できるデータベース名は以下の通りである。<br/>塩基配列:embl emblann emblcds emblcon emblsva refseq<br/>たんぱく質(アミノ酸配列):uniprotkb uniref100 uniref50 uniref90 uniparc unisave refseqp epo_prt jpo_prt uspto_prt<br/>たんぱく質(構造):pdb<br/>文献:medline<br/>その他:genomereviews hgvbase interpro ipi

 

6

Integr8

getProtein

デフォルトの Proteinオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getProtein

6

 

Integr8

 

getProtein

 

デフォルトの Proteinオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getProteinResponse

 

parameters

 

tns:getProteinResponse

 

54

 

デフォルトの Proteinオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

117

WSDBFetchServerLegacy

getSupportedStyles

各データベースごとに対応可能な出力形式名を取得する。

-

-

getSupportedStylesReturn

Show
getSupportedStyles

117

 

WSDBFetchServerLegacy

 

getSupportedStyles

 

各データベースごとに対応可能な出力形式名を取得する。

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし

 

getSupportedStylesResponse

 

getSupportedStylesReturn

 

xsd:string[]

 

2

 

すべてのデータベースについて、対応可能な出力形式名を取得する。

 

$result = getSupportedStyles()

 

以下のようなリストが取得できる。<br/>データベース名と出力形式名間は[TAB]区切り、出力形式名間は、カンマ区切りである。<br/>embl default,html,raw<br/>…<br/>pdb default,html,raw<br/>…

 

118

WSDBFetchServerLegacy

getSupportedFormats

各データベースごとに対応可能なフォーマット名を取得する。

-

-

getSupportedFormatsReturn

Show
getSupportedFormats

118

 

WSDBFetchServerLegacy

 

getSupportedFormats

 

各データベースごとに対応可能なフォーマット名を取得する。

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし

 

getSupportedFormatsResponse

 

getSupportedFormatsReturn

 

xsd:string[]

 

2

 

すべてのデータベースについて、対応可能なフォーマット名を取得する。

 

$result = getSupportedFormats()

 

以下のようなリストが取得できる。<br/>データベース名とフォーマット名間は[TAB]区切り、フォーマット名間は、カンマ区切りである。<br/>embl default,embl,emblxml,fasta,insdxml<br/>…<br/>pdb default,pdb<br/>…

 

7

Integr8

getGene

デフォルトの Geneオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getGene

7

 

Integr8

 

getGene

 

デフォルトの Geneオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getGeneResponse

 

parameters

 

tns:getGeneResponse

 

45

 

デフォルトの Geneオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

8

Integr8

getLocation

デフォルトの Locationオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getLocation

8

 

Integr8

 

getLocation

 

デフォルトの Locationオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getLocationResponse

 

parameters

 

tns:getLocationResponse

 

46

 

デフォルトの Locationオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

10

Integr8

getStringList

デフォルトの StringListオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

-

-

parameters

Show
getStringList

10

 

Integr8

 

getStringList

 

デフォルトの StringListオブジェクトを生成する。WSのクライアントプログラムで利用することは意図していない。
The method dose not be intended to invoke form a WS client program.

 

-

 

-

 

-

 

-

 

 

引数なし。

 

getStringListResponse

 

parameters

 

tns:getStringListResponse

 

55

 

デフォルトの StringListオブジェクトを取得できる。

 

-

 

-

 

103

WSClustalW

alignIds

配列をデータベース検索し、検索結果の配列をマルチプルアラインメントに合わせてアラインメントする。(実行確認できていないため推測)

alignIdsRequest

database

jobid

Show
alignIds

103

 

WSClustalW

 

alignIds

 

配列をデータベース検索し、検索結果の配列をマルチプルアラインメントに合わせてアラインメントする。(実行確認できていないため推測)

 

alignIdsRequest

 

database

 

xsd:string

 

2

 

 

データベース名。

 

alignIdsResponse

 

jobid

 

xsd:string

 

2

 

jobid が得られ、このjobidを用いて、checkStatus, getResults, pollにより結果を得ることができる。

 

alignIds('embl', sequence, clustaw_output, email)

 

実行確認できていない。<br/>機能、入出力については、推測。<br/>実行エラーとなる。(500 internal server error)