Order Cluster ID (Link to Ghost DB) EST sequence similarities (BLASTX results) Clone ID for microarray (From Ghost DB) Average RA:DMSO (Geometrical avg.) Average RA:DMSO (Arithmetic avg.) Reproducibility of RA:DMSO ISH -DMSO ISH -RA

1

13982

CiCyp26, cytochrome P450 RA degrading enzyme

citb029d20

4.828739758

5.39375984

A

13982DMSO001.jpg
13982DMSO005.jpg
13982DMSO012.jpg

13982RA009.jpg
13982RA001.jpg
13982RA002.jpg

Show
13982

1

 

45

 

11

 

11

 

13982

 

CiCyp26, cytochrome P450 RA degrading enzyme

 

citb029d20

 

4.828739758

 

5.39375984

 

A

 

13982

 

13982DMSO001.jpg
13982DMSO005.jpg
13982DMSO012.jpg

 

13982RA009.jpg
13982RA001.jpg
13982RA002.jpg

 

2

01890

CiHox-1

citb014p24

3.949825971

4.769667681

A

-

-

Show
01890

2

 

30

 

4

 

10

 

01890

 

CiHox-1

 

citb014p24

 

3.949825971

 

4.769667681

 

A

 

-

 

-

 

-

 

3

04977

Putative RING-H2 finger protein

cilv006f16

2.802509951

3.14423649

A

04977DMSO012.jpg
04977DMSO013.jpg
04977DMSO005.jpg
04977DMSO021.jpg

04977RA017.jpg
04977RA024.jpg
04977RA014.jpg
04977RA002.jpg

Show
04977

3

 

36

 

5

 

4

 

04977

 

Putative RING-H2 finger protein

 

cilv006f16

 

2.802509951

 

3.14423649

 

A

 

04977

 

04977DMSO012.jpg
04977DMSO013.jpg
04977DMSO005.jpg
04977DMSO021.jpg

 

04977RA017.jpg
04977RA024.jpg
04977RA014.jpg
04977RA002.jpg

 

4

01311

Styela clava intermediate filament protein D

cilv003p09

2.712271056

2.954229531

A

01311DMSO030.jpg
01311DMSO024.jpg
01311DMSO029.jpg
01311DMSO028.jpg

01311RA016.jpg
01311RA001.jpg
01311RA014.jpg
01311RA026.jpg

Show
01311

4

 

43

 

11

 

3

 

01311

 

Styela clava intermediate filament protein D

 

cilv003p09

 

2.712271056

 

2.954229531

 

A

 

01311

 

01311DMSO030.jpg
01311DMSO024.jpg
01311DMSO029.jpg
01311DMSO028.jpg

 

01311RA016.jpg
01311RA001.jpg
01311RA014.jpg
01311RA026.jpg

 

5

13207

Voltage-gated potassium channel DRK1

cilv026c23

2.685547834

2.96193927

A

13207DMSO002.jpg

13207RA028.jpg

Show
13207

5

 

29

 

8

 

6

 

13207

 

Voltage-gated potassium channel DRK1

 

cilv026c23

 

2.685547834

 

2.96193927

 

A

 

13207

 

13207DMSO002.jpg

 

13207RA028.jpg

 

6

10553

Orphan nuclear receptor TR4

cicl056d13

2.586155156

2.693761417

A

10553DMSO011.jpg
10553DMSO012.jpg
10553DMSO015.jpg
10553DMSO021.jpg

10553RA002.jpg
10553RA010.jpg
10553RA020.jpg
10553RA001.jpg

Show
10553

6

 

29

 

5

 

1

 

10553

 

Orphan nuclear receptor TR4

 

cicl056d13

 

2.586155156

 

2.693761417

 

A

 

10553

 

10553DMSO011.jpg
10553DMSO012.jpg
10553DMSO015.jpg
10553DMSO021.jpg

 

10553RA002.jpg
10553RA010.jpg
10553RA020.jpg
10553RA001.jpg

 

7

04845

No similarity

cilv004n11

2.092778983

2.296332531

A

04845DMSO006.jpg
04845DMSO013.jpg
04845DMSO025.jpg
04845DMSO027.jpg

04845RA014.jpg
04845RA010.jpg
04845RA025.jpg
04845RA011.jpg

Show
04845

7

 

25

 

2

 

3

 

04845

 

No similarity

 

cilv004n11

 

2.092778983

 

2.296332531

 

A

 

04845

 

04845DMSO006.jpg
04845DMSO013.jpg
04845DMSO025.jpg
04845DMSO027.jpg

 

04845RA014.jpg
04845RA010.jpg
04845RA025.jpg
04845RA011.jpg

 

8

03348

Steroid hormone receptor-like protein RLD-1, oxysterol receptor LXR-alpha

cilv002c15

2.0059621

2.348752241

B

03348DMSO028.jpg
03348DMSO030.jpg
03348DMSO005.jpg

03348RA035.jpg
03348RA040.jpg
03348RA006.jpg

Show
03348

8

 

34

 

15

 

4

 

03348

 

Steroid hormone receptor-like protein RLD-1, oxysterol receptor LXR-alpha

 

cilv002c15

 

2.0059621

 

2.348752241

 

B

 

03348

 

03348DMSO028.jpg
03348DMSO030.jpg
03348DMSO005.jpg

 

03348RA035.jpg
03348RA040.jpg
03348RA006.jpg

 

9

04817

Inward rectifier potassium channel protein

04817

1.937852596

2.044090245

A

04817DMSO016.jpg
04833DMSO013.jpg
04817DMSO018.jpg
04817DMSO029.jpg

04817RA018.jpg
04817RA019.jpg
04817RA005.jpg
04817RA025.jpg

Show
04817

9

 

6

 

5

 

3

 

04817

 

Inward rectifier potassium channel protein

 

04817

 

1.937852596

 

2.044090245

 

A

 

04817

 

04817DMSO016.jpg
04833DMSO013.jpg
04817DMSO018.jpg
04817DMSO029.jpg

 

04817RA018.jpg
04817RA019.jpg
04817RA005.jpg
04817RA025.jpg

 

10

00840

Sodium-dependent neurotransmitter transporter

citb005d05

1.931389541

2.067459033

A

00840DMSO002.jpg
00840DMSO009.jpg
00840DMSO033.jpg
00840DMSO011.jpg

00840RA015.jpg
00840RA011.jpg
00840RA029.jpg
00840RA023.jpg

Show
00840

10

 

26

 

3

 

9

 

00840

 

Sodium-dependent neurotransmitter transporter

 

citb005d05

 

1.931389541

 

2.067459033

 

A

 

00840

 

00840DMSO002.jpg
00840DMSO009.jpg
00840DMSO033.jpg
00840DMSO011.jpg

 

00840RA015.jpg
00840RA011.jpg
00840RA029.jpg
00840RA023.jpg

 

11

02210

CiCyp26, cytochrome P450 RA degrading enzyme

cicl002j21

1.928226636

2.234000364

B

02210DMSO014.jpg
02210DMSO007.jpg
02210DMSO006.jpg
02210DMSO018.jpg

02210RA017.jpg
02210RA009.jpg
02210RA002.jpg
02210RA008.jpg

Show
02210

11

 

4

 

10

 

2

 

02210

 

CiCyp26, cytochrome P450 RA degrading enzyme

 

cicl002j21

 

1.928226636

 

2.234000364

 

B

 

02210

 

02210DMSO014.jpg
02210DMSO007.jpg
02210DMSO006.jpg
02210DMSO018.jpg

 

02210RA017.jpg
02210RA009.jpg
02210RA002.jpg
02210RA008.jpg

 

12

14629

Putative gene product similar to Ig superfamily protein, encoded by COS2.1 cosmid clone identified by Simmen et al.

cilv028p23

1.815053933

2.399501056

B

14629DMSO024.jpg
14629DMSO019.jpg
14629DMSO031.jpg
14629DMSO027.jpg

14629RA012.jpg
14629RA021.jpg
14629RA030.jpg
14629RA028.jpg

Show
14629

12

 

28

 

2

 

7

 

14629

 

Putative gene product similar to Ig superfamily protein, encoded by COS2.1 cosmid clone identified by Simmen et al.

 

cilv028p23

 

1.815053933

 

2.399501056

 

B

 

14629

 

14629DMSO024.jpg
14629DMSO019.jpg
14629DMSO031.jpg
14629DMSO027.jpg

 

14629RA012.jpg
14629RA021.jpg
14629RA030.jpg
14629RA028.jpg

 

13

00968

Nuclear receptor COUP-TFII, COUP-TFI

cilv028c05

1.809218836

1.959622138

A

00968DMSO009.jpg
00968DMSO015.jpg
00968DMSO025.jpg
00968DMSO031.jpg

00968RA010.jpg
00968RA014.jpg
00968RA028.jpg
00968RA020.jpg

Show
00968

13

 

28

 

7

 

7

 

00968

 

Nuclear receptor COUP-TFII, COUP-TFI

 

cilv028c05

 

1.809218836

 

1.959622138

 

A

 

00968

 

00968DMSO009.jpg
00968DMSO015.jpg
00968DMSO025.jpg
00968DMSO031.jpg

 

00968RA010.jpg
00968RA014.jpg
00968RA028.jpg
00968RA020.jpg

 

14

02553

No similarity

citb028f04

1.789852822

1.878527315

A

02553DMSO026.jpg
02553DMSO019.jpg
02553DMSO008.jpg
02553DMSO005.jpg

02553RA020.jpg
02553RA015.jpg
02553RA002.jpg
02553RA023.jpg

Show
02553

14

 

31

 

14

 

11

 

02553

 

No similarity

 

citb028f04

 

1.789852822

 

1.878527315

 

A

 

02553

 

02553DMSO026.jpg
02553DMSO019.jpg
02553DMSO008.jpg
02553DMSO005.jpg

 

02553RA020.jpg
02553RA015.jpg
02553RA002.jpg
02553RA023.jpg

 

15

08230

UDP-glucose 6-dehydrogenase

cicl045c18

1.761954651

1.928493013

A

08230DMSO011.jpg
08230DMSO008.jpg
08230DMSO009.jpg

08230RA014.jpg
08230RA045.jpg
08230RA024.jpg

Show
08230

15

 

23

 

15

 

13

 

08230

 

UDP-glucose 6-dehydrogenase

 

cicl045c18

 

1.761954651

 

1.928493013

 

A

 

08230

 

08230DMSO011.jpg
08230DMSO008.jpg
08230DMSO009.jpg

 

08230RA014.jpg
08230RA045.jpg
08230RA024.jpg