>AFO492 (AFO492Q) /CSM/AF/AFO4-D/AFO492Q.Seq.d/
ATATTTTTTTTTTATTAATCACACATTACCTGNGGTAATAATAATAATAATAAATAATAA
TAATAATAATATTATTAATATTATTATAATAATAGTTATTTTTAATTTAATTATTACCAT
CATTATTGTAATAAAATAATAATAATTATTAAAATAATAATAATAAAAATAATAATAAAA
ATANTAATAATAATAATAATAATAAATTATTATTAATAATAAAAATAACAATNTAATCAA
GAAAATACCACCCACATACTATTCACACACAAATAATATACTTTAAACGTTNATTATTTT
TATTTTTTNAAATTTTTTTTTTTTTTTTTNAAAAAAAANNTAAXXXXXXXXXXTTGACGG
TAATCTATGTTGTTGTATNAATTGTTGTGANAATTGTTGCGAAATTTGTTGTGGTTGTGG
TTGTTGTAATAATTGTTGAATGTGTTGTTGTTGTTGTTGAAGTATAGCTTGTTGTTGTAA
TAATTGTTGATGTTGTTGTTGTTNACGTTGATGTTGTAATTGAAGTTGTTGCATTGTTGT
TGTGAGTGGTTGTTGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGGCGATGA
TGACGATGATGAGGGAGTAGAGTTTGTATTTGTTGGAATTGTTGGCAAACCAACATCCAA
AGAAATGAATGGCTCTGTTGGTATAAAACCGTATGATGGTGGTGGTTGTGGTATATCCTT
AAATACTTCTCTAATTAAGGAATCTAAAAAATGAATTGCACCTCTATTCTTTGGGTCTAA
TCAATCTACAAAATCTCCAAAATGCAAACATATCTTCTCACCATTC

iffllithylx******iiiiiillill***lfli*llpsll**nnnny*nnnnknnnkn
xnnnnnnkllliikitx*SRKYHPHTIHTQIIYFKRXLFLFFXIFFFFFXKKX---

---LTVIYVVVXIVVXIVAKFVVVVVVVIIVECVVVVVEV*lvvviivdvvvvxvdvvie
vvalll*vvvvmmmmmmmmmmmtammtmmre*slyllellanqhpkk*mallv*nrmmvv
vvvyp*ill*lrnlknelhlyslglinlqnlqnanisshh

Frame A:
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ixiiiiiinyy***k*qxnqentthilfthk*ytlnvxyfyfxkfffffxkkxx---

---LTVIYVVVXIVVXIVAKFVVVVVVVIIVECVVVVVEV*lvvviivdvvvvxvdvvie
vvalll*vvvvmmmmmmmmmmmtammtmmre*slyllellanqhpkk*mallv*nrmmvv
vvvyp*ill*lrnlknelhlyslglinlqnlqnanisshh

Frame B:
yfffinhtlpxviiiiinnnnnniiniiiiivifnliitiiivik***llk****k***k
x*******iiinnknnnxikkipptyyshtnnil*txiififxnfffffxkkx*---

---*r*smllyxll*xllrnllwlwll**llnvlllllkyslll**llmlllxtlml*lk
llhcccewll************rr**r**gsrvcicwncwqtniqrnewlcwyktv*www
lwyilkyfsn*gi*kmnctsilwv*siykiskmqtyllti

Frame C:
iffllithylx******iiiiiillill***lfli*llpsll**nnnny*nnnnknnnkn
xnnnnnnkllliikitx*SRKYHPHTIHTQIIYFKRXLFLFFXIFFFFFXKKX---

---dgnlcccxnccxncceiccgcgccnnc*mccccc*siacccnnc*ccccxr*ccn*s
ccivvvsgccddddddddddddgdddddegvefvfvgivgkptskemngsvgikpydggg
cgislntslikeskk*iaplffgsnqstkspkckhifspf

                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

AFO492 (AFO492Q) /CSM/AF/AFO4-D/AFO492Q.Seq.d/                        424   e-118
AFH608 (AFH608Q) /CSM/AF/AFH6-A/AFH608Q.Seq.d/                        311   9e-84
SLF745 (SLF745Q) /CSM/SL/SLF7-B/SLF745Q.Seq.d/                         38   0.21
SLF592 (SLF592Q) /CSM/SL/SLF5-D/SLF592Q.Seq.d/                         38   0.21
SLE791 (SLE791Q) /CSM/SL/SLE7-D/SLE791Q.Seq.d/                         38   0.21
SLD857 (SLD857Q) /CSM/SL/SLD8-C/SLD857Q.Seq.d/                         38   0.21
SLD503 (SLD503Q) /CSM/SL/SLD5-A/SLD503Q.Seq.d/                         38   0.21
SLC682 (SLC682Q) /CSM/SL/SLC6-D/SLC682Q.Seq.d/                         38   0.21
SLC290 (SLC290Q) /CSM/SL/SLC2-D/SLC290Q.Seq.d/                         38   0.21
CHN833 (CHN833Q) /CSM/CH/CHN8-B/CHN833Q.Seq.d/                         38   0.21

                                                               Score     E
Sequences producing significant alignments:                    (bits)  Value  N

AC007021|AC007021.3 Homo sapiens PAC clone RP6-155F9 from Xq23, complete sequence.    46  0.69  1
AC122196|AC122196.2 Mus musculus chromosome 5 clone RP23-50P5, complete sequence.    36  1.6  3
AC068046|AC068046.3 Homo sapiens chromosome 1 clone RP11-319D10, WORKING DRAFT SEQUENCE, 24 unordered pieces.    44  2.7  1
BG722270|BG722270.1 602693443F1 NIH_MGC_97 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4825714 5', mRNA sequence.    44  2.7  1
BM151976|BM151976.1 TCBAP1E11668 Pediatric pre-B cell acute lymphoblastic leukemia Baylor-HGSC project=TCBA Homo sapiens cDNA clone TCBAP1166, mRNA sequence.    44  2.7  1
BI463082|BI463082.1 603204826F1 NIH_MGC_97 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5270358 5', mRNA sequence.    44  2.7  1
BG536808|BG536808.1 602566345F1 NIH_MGC_77 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4691027 5', mRNA sequence.    44  2.7  1
BG430834|BG430834.1 602500914F1 NIH_MGC_75 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4614651 5', mRNA sequence.    44  2.7  1
BU601801|BU601801.1 AGENCOURT_10013308 NIH_MGC_142 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6495796 5', mRNA sequence.    44  2.7  1
BD032677|BD032677.1 Sequence tag and encoded human protein.       44  2.7  1

 ***** No hits found ******

Lambda     K      H
   0.318    0.134    0.401

Gapped
Lambda     K      H
   0.267   0.0410    0.140

Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Sequences: 3039690
Number of Hits to DB: 549,148,989

 psg: 0.82  gvh: 0.45  alm: 0.03  top: 0.43  tms: 0.20  mit: 0.43  mip: 0.00
 nuc: 0.00  erl: 0.00  erm: 0.20  pox: 0.00  px2: 0.00  vac: 0.00  rnp: 0.00
 act: 0.00  caa: 0.00  yqr: 0.00  tyr: 0.00  leu: 0.00  gpi: 0.00  myr: 0.00
 dna: 0.00  rib: 0.00  bac: 0.00  m1a: 0.00  m1b: 0.00  m2 : 0.00  mNt: 0.00
 m3a: 1.00  m3b: 0.00  m_ : 0.00 

	 36.0 %: endoplasmic reticulum
	 24.0 %: mitochondrial
	 20.0 %: plasma membrane
	  4.0 %: Golgi
	  4.0 %: vacuolar
	  4.0 %: nuclear
	  4.0 %: vesicles of secretory system
	  4.0 %: cytoplasmic

>> prediction for AFO492 is end

>AFO492F.Seq
ATATTTTTTTTTTATTAATCACACATTACCTGNGGTAATAATAATAATAATAAATAATAA
TAATAATAATATTATTAATATTATTATAATAATAGTTATTTTTAATTTAATTATTACCAT
CATTATTGTAATAAAATAATAATAATTATTAAAATAATAATAATAAAAATAATAATAAAA
ATANTAATAATAATAATAATAATAAATTATTATTAATAATAAAAATAACAATNTAATCAA
GAAAATACCACCCACATACTATTCACACACAAATAATATACTTTAAACGTTNATTATTTT
TATTTTTTNAAATTTTTTTTTTTTTTTTTNAAAAAAAANNTAA----------

>AFO492Z.Seq
----------TTGACGGTAATCTATGTTGTTGTATNAATTGTTGTGANAATTGTTGCGAA
ATTTGTTGTGGTTGTGGTTGTTGTAATAATTGTTGAATGTGTTGTTGTTGTTGTTGAAGT
ATAGCTTGTTGTTGTAATAATTGTTGATGTTGTTGTTGTTNACGTTGATGTTGTAATTGA
AGTTGTTGCATTGTTGTTGTGAGTGGTTGTTGTGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
GATGATGACGGCGATGATGACGATGATGAGGGAGTAGAGTTTGTATTTGTTGGAATTGTT
GGCAAACCAACATCCAAAGAAATGAATGGCTCTGTTGGTATAAAACCGTATGATGGTGGT
GGTTGTGGTATATCCTTAAATACTTCTCTAATTAAGGAATCTAAAAAATGAATTGCACCT
CTATTCTTTGGGTCTAATCAATCTACAAAATCTCCAAAATGCAAACATATCTTCTCACCA
TTC

>AFO492P.Seq
ATATTTTTTTTTTATTAATCACACATTACCTGNGGTAATAATAATAATAATAAATAATAA
TAATAATAATATTATTAATATTATTATAATAATAGTTATTTTTAATTTAATTATTACCAT
CATTATTGTAATAAAATAATAATAATTATTAAAATAATAATAATAAAAATAATAATAAAA
ATANTAATAATAATAATAATAATAAATTATTATTAATAATAAAAATAACAATNTAATCAA
GAAAATACCACCCACATACTATTCACACACAAATAATATACTTTAAACGTTNATTATTTT
TATTTTTTNAAATTTTTTTTTTTTTTTTTNAAAAAAAANNTAA----------TTGACGG
TAATCTATGTTGTTGTATNAATTGTTGTGANAATTGTTGCGAAATTTGTTGTGGTTGTGG
TTGTTGTAATAATTGTTGAATGTGTTGTTGTTGTTGTTGAAGTATAGCTTGTTGTTGTAA
TAATTGTTGATGTTGTTGTTGTTNACGTTGATGTTGTAATTGAAGTTGTTGCATTGTTGT
TGTGAGTGGTTGTTGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGGCGATGA
TGACGATGATGAGGGAGTAGAGTTTGTATTTGTTGGAATTGTTGGCAAACCAACATCCAA
AGAAATGAATGGCTCTGTTGGTATAAAACCGTATGATGGTGGTGGTTGTGGTATATCCTT
AAATACTTCTCTAATTAAGGAATCTAAAAAATGAATTGCACCTCTATTCTTTGGGTCTAA
TCAATCTACAAAATCTCCAAAATGCAAACATATCTTCTCACCATTC