>CHP631 (CHP631Q) /CSM/CH/CHP6-B/CHP631Q.Seq.d/
GTTGGCCTACTGGNAAAATAAAATTCATTTAATAATAATAATTTAATTTTTTTCATAGTA
TTCAAAGNATATAATGAAAAACTTTTATTATTTTATATTAATTTTATTATTTTTTAATGA
AGTTTGCTATTCATTAAAAGATGGTGAAATTAAACTTCATTTAATTCCACATTCACATTG
TGATTCTGGATGGACATCAACAATGAACGAATATTATATGGGTCAAGTTAAAAGTATTAT
ATCATCAATGGTTCAATCATTAAATGTTGAATCAAATCCACCTAGAAAATTTGTTTGGTC
TGAAATTGGATTTTTAGAACAATGGTGGGATGATATGCCAATTGAAATTAAAAATGATTT
TATAAAACATGTTAAAAATGATAGAATTGAATTTGTAAATGGTGGATGGGTAATGAATGA
TGAAGCATGTGCAAGTTTAGAAAGTGTAATTAGACAATTATCAAATGGACATAAATTTAT
TAGAGAGAAATTTGGAAAACAACCAGAGAGTGGATGGCAAATTGATCCATTTGGACATTC
ATCATTGACACCAACATTACAAGCTCXXXXXXXXXXTGTTTGTAATAATGATAGATCAAG
AGGTGTTTCAAGTCAAGGTCAAGGTTGCTTGGAAATGGCATTACATAGAAGTTTAACTTA
TGAAGATGGTAAAGGTTTAGAAATTCCTGCAATTGATGAATCCTCAATTAATGCACGTTT
TGAATGTTATTTAGATGAAGTACCATCAAATTCACAACAATCGAATGGTGGTGGTGGTGG
TGATGATATTAGAAAACAATCAATTAATTATCAACATAAATTCCAAATTTATCAAGGTCA
AGATTCTTCTTATATGTCTTCAAAATCTTTTATGTTAAAACCATTACCAGAGTTTATTCA
TATTCTATCAATGGAAAGATCTGGTCCTCGTTCAATTAAATTAAGAATTCATAATATTGA
AAATAATAATCAATCTCCAATCACTTTTGATTTAAATGGCTTATTCTCTTTTATCAAATC
AATTAAATCAATTAAAGAATATAATTTATCTTTAATCAATAGATTCGTTGATAATAATAT
TGATAATATTATTTCTTCTCATCGTTCAATTGTTGGAAAAAATCTTTTCCCTATTAAAGA
TACTCCAACTCGTTTCAACCCAATTAATACAAAACAAACTAAAATTACCTTATA

laywxnkihliiii*ffs*YSKXIMKNFYYFILILLFFNEVCYSLKDGEIKLHLIPHSHC
DSGWTSTMNEYYMGQVKSIISSMVQSLNVESNPPRKFVWSEIGFLEQWWDDMPIEIKNDF
IKHVKNDRIEFVNGGWVMNDEACASLESVIRQLSNGHKFIREKFGKQPESGWQIDPFGHS
SLTPTLQA---

---VCNNDRSRGVSSQGQGCLEMALHRSLTYEDGKGLEIPAIDESSINARFECYLDEVPS
NSQQSNGGGGGDDIRKQSINYQHKFQIYQGQDSSYMSSKSFMLKPLPEFIHILSMERSGP
RSIKLRIHNIENNNQSPITFDLNGLFSFIKSIKSIKEYNLSLINRFVDNNIDNIISSHRS
IVGKNLFPIKDTPTRFNPINTKQTKITL

Frame A:
vgllxk*nsfnnnnliffivfkxyneklllfyinfiif**sllfikrw*n*tsfnstftl
*fwmdinnerilygss*kyyiingsiikc*ikst*kiclv*nwifrtmvg*yan*n*k*f
yktc*k**n*ickwwmgne**smckfrkcn*tiikwt*iy*reiwkttrewman*siwtf
iidtnits---

---cl****ikrcfksrsrllgngit*kfnl*rw*rfrnscn**iln*ctf*mlfr*sti
kfttiewwwww**y*ktin*lst*ipnlsrsrfflyvfkifyvktitrvysysingkiws
sfn*ikns*y*k**sisnhf*fkwlilfyqin*in*ri*fifnq*ir***y**yyffssf
ncwkksfpy*rysnsfqpn*yktn*nyli

Frame B:
laywxnkihliiii*ffs*YSKXIMKNFYYFILILLFFNEVCYSLKDGEIKLHLIPHSHC
DSGWTSTMNEYYMGQVKSIISSMVQSLNVESNPPRKFVWSEIGFLEQWWDDMPIEIKNDF
IKHVKNDRIEFVNGGWVMNDEACASLESVIRQLSNGHKFIREKFGKQPESGWQIDPFGHS
SLTPTLQA---

---VCNNDRSRGVSSQGQGCLEMALHRSLTYEDGKGLEIPAIDESSINARFECYLDEVPS
NSQQSNGGGGGDDIRKQSINYQHKFQIYQGQDSSYMSSKSFMLKPLPEFIHILSMERSGP
RSIKLRIHNIENNNQSPITFDLNGLFSFIKSIKSIKEYNLSLINRFVDNNIDNIISSHRS
IVGKNLFPIKDTPTRFNPINTKQTKITL

Frame C:
wptgkikfi****fnffhsiqxi**ktfiily*fyyflmkfaih*kmvklnfi*fhihiv
ildghqq*tniiwvklkvlyhqwfnh*mlnqihlenlfglkldf*nnggmicqlklkmil
*nmlkmielnl*mvdg**mmkhvqv*kv*ldnyqmdinllernlennqrvdgklihldih
h*hqhykl---

---fvimidqevfqvkvkvawkwhyiev*lmkmvkv*kflqlmnpqlmhvlnvi*mkyhq
ihnnrmvvvvvmilennqliininskfikvkilliclqnllc*nhyqslfifyqwkdlvl
vqln*efiilkiiinlqslli*maysllsnqlnqlkniiyl*sidsliiiliilfllivq
llekifsllkilqlvstqliqnklklpy

                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

SHL630 (SHL630Q) /CSM/SH/SHL6-B/SHL630Q.Seq.d/                        892   0.0
SHL340 (SHL340Q) /CSM/SH/SHL3-B/SHL340Q.Seq.d/                        892   0.0
SHL334 (SHL334Q) /CSM/SH/SHL3-B/SHL334Q.Seq.d/                        892   0.0
SHL308 (SHL308Q) /CSM/SH/SHL3-A/SHL308Q.Seq.d/                        892   0.0
SHL251 (SHL251Q) /CSM/SH/SHL2-C/SHL251Q.Seq.d/                        892   0.0
SHL163 (SHL163Q) /CSM/SH/SHL1-C/SHL163Q.Seq.d/                        892   0.0
SHK566 (SHK566Q) /CSM/SH/SHK5-C/SHK566Q.Seq.d/                        892   0.0
SHK514 (SHK514Q) /CSM/SH/SHK5-A/SHK514Q.Seq.d/                        892   0.0
SHK450 (SHK450Q) /CSM/SH/SHK4-C/SHK450Q.Seq.d/                        892   0.0
SHK365 (SHK365Q) /CSM/SH/SHK3-C/SHK365Q.Seq.d/                        892   0.0

                                                             Score    E
Sequences producing significant alignments:                  (bits) Value  N

AE017263|AE017263.1 Mesoplasma florum L1 complete genome.          36   1e-14  32
AC116984|AC116984.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 2567470-3108875 strain AX4, complete sequence.    38   4e-13  20
CR382400|CR382400.1 Plasmodium falciparum chromosome 6, complete sequence; segment 3/5.    32   1e-12  23
AF250284|AF250284.1 Amsacta moorei entomopoxvirus, complete genome.    44   7e-11  16
AE014816|AE014816.1 Plasmodium falciparum 3D7 chromosome 14 section 1 of 13 of the complete sequence.    38   9e-11  19
AC117176|AC117176.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 5018074-5200947 strain AX4, complete sequence.    40   2e-10  13
AE017332|AE017332.1 Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome.    34   2e-10  30
AC116957|AC116957.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 1685067-2090751 strain AX4, complete sequence.    40   6e-10  17
AC117076|AC117076.3 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 3323568-3470138 strain AX4, complete sequence.    36   9e-10  14
AL929357|AL929357.1 Plasmodium falciparum strain 3D7, chromosome 9; segment 3/5.    34   1e-09  20

                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

(Q54YC4) RecName: Full=Alpha-mannosidase D;          EC=3.2.1.24...   136   1e-30
AB011474_23(AB011474|pid:none) Arabidopsis thaliana genomic DNA,...   135   2e-30
(Q54YF7) RecName: Full=Alpha-mannosidase B;          EC=3.2.1.24...   134   6e-30
AC148217_12(AC148217|pid:none) Medicago truncatula clone mth2-20...   132   2e-29
AK161799_1(AK161799|pid:none) Mus musculus 13 days embryo male t...   128   4e-28
AF107018_1(AF107018|pid:none) Mus musculus alpha-mannosidase IIx...   128   4e-28
BC142656_1(BC142656|pid:none) Homo sapiens mannosidase, alpha, c...   127   1e-27
L28821_1(L28821|pid:none) Homo sapiens alpha mannosidase II isoz...   126   1e-27
(P49641) RecName: Full=Alpha-mannosidase 2x;          EC=3.2.1.1...   126   1e-27
AL391146_7(AL391146|pid:none) Arabidopsis thaliana DNA chromosom...   125   4e-27

 psg: 1.02  gvh: 0.66  alm: 0.48  top: 0.30  tms: 0.00  mit: 0.35  mip: 0.00
 nuc: 0.00  erl: 0.00  erm: 0.20  pox: 0.00  px2: 0.00  vac: 0.00  rnp: 0.00
 act: 0.00  caa: 0.00  yqr: 0.00  tyr: 0.00  leu: 0.00  gpi: 0.00  myr: 0.00
 dna: 0.00  rib: 0.00  bac: 0.00  m1a: 0.00  m1b: 0.00  m2 : 0.00  mNt: 0.00
 m3a: 0.00  m3b: 0.00  m_ : 1.00 

	 56.0 %: extracellular, including cell wall
	 16.0 %: vacuolar
	  8.0 %: cytoplasmic
	  8.0 %: nuclear
	  4.0 %: mitochondrial
	  4.0 %: Golgi
	  4.0 %: endoplasmic reticulum

>> prediction for CHP631 is exc

>CHP631F.Seq
GTTGGCCTACTGGNAAAATAAAATTCATTTAATAATAATAATTTAATTTTTTTCATAGTA
TTCAAAGNATATAATGAAAAACTTTTATTATTTTATATTAATTTTATTATTTTTTAATGA
AGTTTGCTATTCATTAAAAGATGGTGAAATTAAACTTCATTTAATTCCACATTCACATTG
TGATTCTGGATGGACATCAACAATGAACGAATATTATATGGGTCAAGTTAAAAGTATTAT
ATCATCAATGGTTCAATCATTAAATGTTGAATCAAATCCACCTAGAAAATTTGTTTGGTC
TGAAATTGGATTTTTAGAACAATGGTGGGATGATATGCCAATTGAAATTAAAAATGATTT
TATAAAACATGTTAAAAATGATAGAATTGAATTTGTAAATGGTGGATGGGTAATGAATGA
TGAAGCATGTGCAAGTTTAGAAAGTGTAATTAGACAATTATCAAATGGACATAAATTTAT
TAGAGAGAAATTTGGAAAACAACCAGAGAGTGGATGGCAAATTGATCCATTTGGACATTC
ATCATTGACACCAACATTACAAGCTCNNNNNNNNNN

>CHP631Z.Seq
NNNNNNNNNNTGTTTGTAATAATGATAGATCAAGAGGTGTTTCAAGTCAAGGTCAAGGTT
GCTTGGAAATGGCATTACATAGAAGTTTAACTTATGAAGATGGTAAAGGTTTAGAAATTC
CTGCAATTGATGAATCCTCAATTAATGCACGTTTTGAATGTTATTTAGATGAAGTACCAT
CAAATTCACAACAATCGAATGGTGGTGGTGGTGGTGATGATATTAGAAAACAATCAATTA
ATTATCAACATAAATTCCAAATTTATCAAGGTCAAGATTCTTCTTATATGTCTTCAAAAT
CTTTTATGTTAAAACCATTACCAGAGTTTATTCATATTCTATCAATGGAAAGATCTGGTC
CTCGTTCAATTAAATTAAGAATTCATAATATTGAAAATAATAATCAATCTCCAATCACTT
TTGATTTAAATGGCTTATTCTCTTTTATCAAATCAATTAAATCAATTAAAGAATATAATT
TATCTTTAATCAATAGATTCGTTGATAATAATATTGATAATATTATTTCTTCTCATCGTT
CAATTGTTGGAAAAAATCTTTTCCCTATTAAAGATACTCCAACTCGTTTCAACCCAATTA
ATACAAAACAAACTAAAATTACCTTATA

>CHP631P.Seq
GTTGGCCTACTGGNAAAATAAAATTCATTTAATAATAATAATTTAATTTTTTTCATAGTA
TTCAAAGNATATAATGAAAAACTTTTATTATTTTATATTAATTTTATTATTTTTTAATGA
AGTTTGCTATTCATTAAAAGATGGTGAAATTAAACTTCATTTAATTCCACATTCACATTG
TGATTCTGGATGGACATCAACAATGAACGAATATTATATGGGTCAAGTTAAAAGTATTAT
ATCATCAATGGTTCAATCATTAAATGTTGAATCAAATCCACCTAGAAAATTTGTTTGGTC
TGAAATTGGATTTTTAGAACAATGGTGGGATGATATGCCAATTGAAATTAAAAATGATTT
TATAAAACATGTTAAAAATGATAGAATTGAATTTGTAAATGGTGGATGGGTAATGAATGA
TGAAGCATGTGCAAGTTTAGAAAGTGTAATTAGACAATTATCAAATGGACATAAATTTAT
TAGAGAGAAATTTGGAAAACAACCAGAGAGTGGATGGCAAATTGATCCATTTGGACATTC
ATCATTGACACCAACATTACAAGCTC----------TGTTTGTAATAATGATAGATCAAG
AGGTGTTTCAAGTCAAGGTCAAGGTTGCTTGGAAATGGCATTACATAGAAGTTTAACTTA
TGAAGATGGTAAAGGTTTAGAAATTCCTGCAATTGATGAATCCTCAATTAATGCACGTTT
TGAATGTTATTTAGATGAAGTACCATCAAATTCACAACAATCGAATGGTGGTGGTGGTGG
TGATGATATTAGAAAACAATCAATTAATTATCAACATAAATTCCAAATTTATCAAGGTCA
AGATTCTTCTTATATGTCTTCAAAATCTTTTATGTTAAAACCATTACCAGAGTTTATTCA
TATTCTATCAATGGAAAGATCTGGTCCTCGTTCAATTAAATTAAGAATTCATAATATTGA
AAATAATAATCAATCTCCAATCACTTTTGATTTAAATGGCTTATTCTCTTTTATCAAATC
AATTAAATCAATTAAAGAATATAATTTATCTTTAATCAATAGATTCGTTGATAATAATAT
TGATAATATTATTTCTTCTCATCGTTCAATTGTTGGAAAAAATCTTTTCCCTATTAAAGA
TACTCCAACTCGTTTCAACCCAATTAATACAAAACAAACTAAAATTACCTTATA