>CHG664 (CHG664Q) /CSM/CH/CHG6-C/CHG664Q.Seq.d/
ATCAGTGGTAGTCTTAATAATGGTATTATTGAATTTATTTATACTTATGGATTACTAAAG
AATGATTTTATAGTTTTAAATATCTATGATTCAAATTCAGAATATACAATTTTAGAACAA
AATAGTTATTATCAATCATTTTTAGATACCCTTTCATTTCCACAACTATATGATCAAAAT
TATGATTTTAATGCAGAGAATATATCAAAAATTAGTTTCTTTTATAATGACGTAAATTTA
ACAAATTCATATGGTTATAATATAATGTACCTTGAAACATATGATACTCCATTACCATTT
AATCCATGTCTTCAAATTATACCTCAATGGGATAATATAACAATTAAAGGTGAATGGGTA
AATTCTCGTTATGAATTTATATTTTACATGCCTCCAAATATTGTTCCAGGAGCTTTTGAA
TATGCTATAAAAACTCCAAATTTACAATATATTTTAAATACTGAATTACCTGATGAATTC
CAATTGAATATAATTAGTGATCATATTGATTTAATGGGACCAATTGTAACAACAATGAAT
AAAGAACCAAGTTTAGGTGTGGCACTAATAGATAATGAAAATTATAATCTTAGTTGGACA
TTTACAGTXXXXXXXXXXAATTAATTCCAAATGTTTCAATATATTCATCTAATATTATAA
ATAAAAATGGATCAATGACACCAATTTCAGTAGAGATTGAATACTTTGAAAATGAAAGAA
AAATTGAATTTGCAGGTCAAGAAATTATAATGAAACCATCATCAATTAAATATACAATTT
ATATTGATCAATATCCATTTTCAACAAAATTGAGTCAATTACAATTAATTATATCAGCCA
CTGCAATAATTAATTCAAATTCAGATTCATGTTCAAATAAAGAATTTGATAATACAACAA
GTGAAAGTTCAGATTATGTTAAATTATCAATATCAGGTAAAAGTTTATATGGTAGATTCA
TAAGGAGAGCGTTGGTTGATTCAACTCCAATTACAATTTCAAATGAATTATTAGATAAAT
CATTAGGTGCAATTAGTGATTCTCACACATCCCAATCATTTATTGGTATTAATATACCAA
TCTATAATAAAAATGTTAAAATTGATCCAGATTTCTCATTAATTCTCAATTCAAATCCAT
CAACAACAACAAATGAAAATTCAATTTGTTCTGCAAAATCAACAAAATCCAAATCTGGTT
TAACAACAGCCCAGTTAGCAGGGATAATTGTTGGTTCCGTTGGTGCTATTGCAATTGTTT
TTGCCACTGTTGTCACAATAAAAAGAAAAAAAGCTCTAAAAAAAGAAATGAAGGTGTTTG
GGAAAAAAATGCAAGCAATAAATAATTAATAAATTGTCTTTAAAAATCAAATCGACATTT
TAAAATTTTT

ISGSLNNGIIEFIYTYGLLKNDFIVLNIYDSNSEYTILEQNSYYQSFLDTLSFPQLYDQN
YDFNAENISKISFFYNDVNLTNSYGYNIMYLETYDTPLPFNPCLQIIPQWDNITIKGEWV
NSRYEFIFYMPPNIVPGAFEYAIKTPNLQYILNTELPDEFQLNIISDHIDLMGPIVTTMN
KEPSLGVALIDNENYNLSWTFT---

---LIPNVSIYSSNIINKNGSMTPISVEIEYFENERKIEFAGQEIIMKPSSIKYTIYIDQ
YPFSTKLSQLQLIISATAIINSNSDSCSNKEFDNTTSESSDYVKLSISGKSLYGRFIRRA
LVDSTPITISNELLDKSLGAISDSHTSQSFIGINIPIYNKNVKIDPDFSLILNSNPSTTT
NENSICSAKSTKSKSGLTTAQLAGIIVGSVGAIAIVFATVVTIKRKKALKKEMKVFGKKM
QAINN**ivfknqidilkf

Frame A:
ISGSLNNGIIEFIYTYGLLKNDFIVLNIYDSNSEYTILEQNSYYQSFLDTLSFPQLYDQN
YDFNAENISKISFFYNDVNLTNSYGYNIMYLETYDTPLPFNPCLQIIPQWDNITIKGEWV
NSRYEFIFYMPPNIVPGAFEYAIKTPNLQYILNTELPDEFQLNIISDHIDLMGPIVTTMN
KEPSLGVALIDNENYNLSWTFT---

---n*fqmfqyihlil*ikmdq*hqfq*rlntlkmkeklnlqvkkl**nhhqlniqfili
nihfqqn*vnyn*lyqplq*liqiqihvqiknliiqqvkvqimlnyqyqvkvymvds*ge
rwliqlqlqfqmny*inh*vqlvilthpnhllvliyqsiikmlkliqish*fsiqihqqq
qmkiqfvlqnqqnpnlv*qqps*qg*llvplvllqlflpllsq*kekkl*kkk*rclgkk
ckq*iinklslkikstf*nf

Frame B:
svvvlimvllnlfilmdy*rmil*f*ismiqiqniqf*nkiviinhf*ipfhfhnymiki
milmqriyqklvsfimt*i*qihmvii*ctlkhmilhyhlihvfklylngii*qlkvng*
ilvmnlyftclqilfqellnml*klqiynif*ilnylmnsn*i*lviili*wdql*qq*i
knqv*vwh**imkiiilvghlq---

---inskcfnifi*yyk*kwindtnfsrd*il*k*kkn*icrsrnynetiin*iynly*s
isifnkiesitinyishcnn*fkfrfmfk*ri**ynk*kfrlc*iinir*kfiw*ihkes
vg*fnsnynfk*iir*iircn**fshipiiywy*ytnl**kc*n*srflinsqfksinnn
k*kfnlfckinkiqiwfnnspvsrdncwfrwcycncfchcchnkkkksskkrnegvwekn
asnk*lincl*ksnrhfkif

Frame C:
qw*s**wyy*iylylwitke*fysfkyl*fkfriynfrtk*llsiifrypfistti*skl
*f*creyikn*fll**rkfnkfiwl*ynvp*ni*ysiti*smssnytsmg*ynn*r*mgk
fsl*iyilhaskycsrsf*icyknskftiyfky*it**ipieyn**sy*fngtncnnne*
rtkfrcgtnr**kl*s*ldiys---

---LIPNVSIYSSNIINKNGSMTPISVEIEYFENERKIEFAGQEIIMKPSSIKYTIYIDQ
YPFSTKLSQLQLIISATAIINSNSDSCSNKEFDNTTSESSDYVKLSISGKSLYGRFIRRA
LVDSTPITISNELLDKSLGAISDSHTSQSFIGINIPIYNKNVKIDPDFSLILNSNPSTTT
NENSICSAKSTKSKSGLTTAQLAGIIVGSVGAIAIVFATVVTIKRKKALKKEMKVFGKKM
QAINN**ivfknqidilkf

                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

CHG664 (CHG664Q) /CSM/CH/CHG6-C/CHG664Q.Seq.d/                       2476   0.0
SHC204 (SHC204Q) /CSM/SH/SHC2-A/SHC204Q.Seq.d/                       1237   0.0
CHL276 (CHL276Q) /CSM/CH/CHL2-D/CHL276Q.Seq.d/                       1045   0.0
CHN237 (CHN237Q) /CSM/CH/CHN2-B/CHN237Q.Seq.d/                         58   4e-07
FC-BS23 (FC-BS23Q) /CSM/FC/FC-BS/FC-BS23Q.Seq.d/                       52   2e-05
FC-BT04 (FC-BT04Q) /CSM/FC/FC-BT/FC-BT04Q.Seq.d/                       50   9e-05
VFE449 (VFE449Q) /CSM/VF/VFE4-C/VFE449Q.Seq.d/                         42   0.023
SSM168 (SSM168Q) /CSM/SS/SSM1-C/SSM168Q.Seq.d/                         42   0.023
SSL394 (SSL394Q) /CSM/SS/SSL3-D/SSL394Q.Seq.d/                         42   0.023
SSD765 (SSD765Q) /CSM/SS/SSD7-C/SSD765Q.Seq.d/                         42   0.023

                                                             Score    E
Sequences producing significant alignments:                  (bits) Value  N

AC116957|AC116957.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 1685067-2090751 strain AX4, complete sequence.    38   7e-16  29
AC116963|AC116963.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 4657875-4914984 strain AX4, complete sequence.    34   4e-15  23
AB063521|AB063521.2 Wigglesworthia brevipalpis DNA, complete genome, section 1/2.    32   4e-15  27
AC116982|AC116982.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 3622643-3879522 strain AX4, complete sequence.    40   6e-15  26
AL844506|AL844506.1 Plasmodium falciparum chromosome  7.           36   1e-14  33
AC117075|AC117075.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 5201047-5455781 strain AX4, complete sequence.    40   3e-14  23
AC116984|AC116984.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 2567470-3108875 strain AX4, complete sequence.    38   1e-13  29
AC117176|AC117176.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 5018074-5200947 strain AX4, complete sequence.    40   8e-13  18
AF165818|AF165818.4 Guillardia theta nucleomorph chromosome 1, complete sequence.    32   2e-12  24
AC116100|AC116100.2 Dictyostelium discoideum chromosome 2 map 6163571-6199719 strain AX4, complete sequence.    58   2e-12  10

                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

AC116984_63(AC116984|pid:none) Dictyostelium discoideum chromoso...   145   3e-33
AC116100_9(AC116100|pid:none) Dictyostelium discoideum chromosom...   145   3e-33
AC115612_9(AC115612|pid:none) Dictyostelium discoideum chromosom...   142   2e-32
AC116984_70(AC116984|pid:none) Dictyostelium discoideum chromoso...   140   1e-31
AC115680_4(AC115680|pid:none) Dictyostelium discoideum chromosom...   139   3e-31
AC116984_134(AC116984|pid:none) Dictyostelium discoideum chromos...   138   5e-31
AC116957_18(AC116957|pid:none) Dictyostelium discoideum chromoso...   124   1e-26
AC117075_93(AC117075|pid:none) Dictyostelium discoideum chromoso...   119   3e-25
AC116984_67(AC116984|pid:none) Dictyostelium discoideum chromoso...   118   5e-25
AC116924_8(AC116924|pid:none) Dictyostelium discoideum chromosom...   114   6e-24

 psg: 0.75  gvh: 0.39  alm: 0.19  top: 0.87  tms: 0.07  mit: 0.16  mip: 0.00
 nuc: 0.04  erl: 0.00  erm: 0.00  pox: 0.00  px2: 0.00  vac: 0.00  rnp: 0.00
 act: 0.00  caa: 0.00  yqr: 1.00  tyr: 0.00  leu: 0.02  gpi: 0.00  myr: 0.00
 dna: 0.00  rib: 0.00  bac: 0.00  m1a: 0.00  m1b: 0.00  m2 : 0.00  mNt: 1.00
 m3a: 0.00  m3b: 0.00  m_ : 0.00 

	 24.0 %: cytoplasmic
	 20.0 %: nuclear
	 16.0 %: vesicles of secretory system
	 12.0 %: mitochondrial
	  8.0 %: Golgi
	  8.0 %: endoplasmic reticulum
	  4.0 %: extracellular, including cell wall
	  4.0 %: cytoskeletal
	  4.0 %: plasma membrane

>> prediction for CHG664 is cyt

>CHG664F.Seq
ATCAGTGGTAGTCTTAATAATGGTATTATTGAATTTATTTATACTTATGGATTACTAAAG
AATGATTTTATAGTTTTAAATATCTATGATTCAAATTCAGAATATACAATTTTAGAACAA
AATAGTTATTATCAATCATTTTTAGATACCCTTTCATTTCCACAACTATATGATCAAAAT
TATGATTTTAATGCAGAGAATATATCAAAAATTAGTTTCTTTTATAATGACGTAAATTTA
ACAAATTCATATGGTTATAATATAATGTACCTTGAAACATATGATACTCCATTACCATTT
AATCCATGTCTTCAAATTATACCTCAATGGGATAATATAACAATTAAAGGTGAATGGGTA
AATTCTCGTTATGAATTTATATTTTACATGCCTCCAAATATTGTTCCAGGAGCTTTTGAA
TATGCTATAAAAACTCCAAATTTACAATATATTTTAAATACTGAATTACCTGATGAATTC
CAATTGAATATAATTAGTGATCATATTGATTTAATGGGACCAATTGTAACAACAATGAAT
AAAGAACCAAGTTTAGGTGTGGCACTAATAGATAATGAAAATTATAATCTTAGTTGGACA
TTTACAGTNNNNNNNNNN

>CHG664Z.Seq
NNNNNNNNNNAATTAATTCCAAATGTTTCAATATATTCATCTAATATTATAAATAAAAAT
GGATCAATGACACCAATTTCAGTAGAGATTGAATACTTTGAAAATGAAAGAAAAATTGAA
TTTGCAGGTCAAGAAATTATAATGAAACCATCATCAATTAAATATACAATTTATATTGAT
CAATATCCATTTTCAACAAAATTGAGTCAATTACAATTAATTATATCAGCCACTGCAATA
ATTAATTCAAATTCAGATTCATGTTCAAATAAAGAATTTGATAATACAACAAGTGAAAGT
TCAGATTATGTTAAATTATCAATATCAGGTAAAAGTTTATATGGTAGATTCATAAGGAGA
GCGTTGGTTGATTCAACTCCAATTACAATTTCAAATGAATTATTAGATAAATCATTAGGT
GCAATTAGTGATTCTCACACATCCCAATCATTTATTGGTATTAATATACCAATCTATAAT
AAAAATGTTAAAATTGATCCAGATTTCTCATTAATTCTCAATTCAAATCCATCAACAACA
ACAAATGAAAATTCAATTTGTTCTGCAAAATCAACAAAATCCAAATCTGGTTTAACAACA
GCCCAGTTAGCAGGGATAATTGTTGGTTCCGTTGGTGCTATTGCAATTGTTTTTGCCACT
GTTGTCACAATAAAAAGAAAAAAAGCTCTAAAAAAAGAAATGAAGGTGTTTGGGAAAAAA
ATGCAAGCAATAAATAATTAATAAATTGTCTTTAAAAATCAAATCGACATTTTAAAATTT
TT

>CHG664P.Seq
ATCAGTGGTAGTCTTAATAATGGTATTATTGAATTTATTTATACTTATGGATTACTAAAG
AATGATTTTATAGTTTTAAATATCTATGATTCAAATTCAGAATATACAATTTTAGAACAA
AATAGTTATTATCAATCATTTTTAGATACCCTTTCATTTCCACAACTATATGATCAAAAT
TATGATTTTAATGCAGAGAATATATCAAAAATTAGTTTCTTTTATAATGACGTAAATTTA
ACAAATTCATATGGTTATAATATAATGTACCTTGAAACATATGATACTCCATTACCATTT
AATCCATGTCTTCAAATTATACCTCAATGGGATAATATAACAATTAAAGGTGAATGGGTA
AATTCTCGTTATGAATTTATATTTTACATGCCTCCAAATATTGTTCCAGGAGCTTTTGAA
TATGCTATAAAAACTCCAAATTTACAATATATTTTAAATACTGAATTACCTGATGAATTC
CAATTGAATATAATTAGTGATCATATTGATTTAATGGGACCAATTGTAACAACAATGAAT
AAAGAACCAAGTTTAGGTGTGGCACTAATAGATAATGAAAATTATAATCTTAGTTGGACA
TTTACAGT----------AATTAATTCCAAATGTTTCAATATATTCATCTAATATTATAA
ATAAAAATGGATCAATGACACCAATTTCAGTAGAGATTGAATACTTTGAAAATGAAAGAA
AAATTGAATTTGCAGGTCAAGAAATTATAATGAAACCATCATCAATTAAATATACAATTT
ATATTGATCAATATCCATTTTCAACAAAATTGAGTCAATTACAATTAATTATATCAGCCA
CTGCAATAATTAATTCAAATTCAGATTCATGTTCAAATAAAGAATTTGATAATACAACAA
GTGAAAGTTCAGATTATGTTAAATTATCAATATCAGGTAAAAGTTTATATGGTAGATTCA
TAAGGAGAGCGTTGGTTGATTCAACTCCAATTACAATTTCAAATGAATTATTAGATAAAT
CATTAGGTGCAATTAGTGATTCTCACACATCCCAATCATTTATTGGTATTAATATACCAA
TCTATAATAAAAATGTTAAAATTGATCCAGATTTCTCATTAATTCTCAATTCAAATCCAT
CAACAACAACAAATGAAAATTCAATTTGTTCTGCAAAATCAACAAAATCCAAATCTGGTT
TAACAACAGCCCAGTTAGCAGGGATAATTGTTGGTTCCGTTGGTGCTATTGCAATTGTTT
TTGCCACTGTTGTCACAATAAAAAGAAAAAAAGCTCTAAAAAAAGAAATGAAGGTGTTTG
GGAAAAAAATGCAAGCAATAAATAATTAATAAATTGTCTTTAAAAATCAAATCGACATTT
TAAAATTTTT